Daniel Rafecas fue designado como juez de la causa Hotesur tras el apartamento de Claudio Bonadio y ya comenzó a tomar decisiones de peso: le quitó a la Policía Metropolitana las pruebas obtenidas en los allanamientos en el Sur.
Bonadio le había ordenado a la Metropolitana que realizara procedimientos en Río Gallegos, Bariloche y la ciudad de Buenos Aires, lo que generó fuertes cuestionamientos en su contra: sus detractores argumentaban que utilizó una policía que reporta la Ciudad y no una de alcance federal.
El material secuestrado en los allanamientos nunca estuvo en manos del apartado juez, revelaron fuentes judiciales, ya que cuando llegaron a Buenos Aires, ya no estaba a cargo de la causa.
La investigación se inició con una denuncia de la diputada nacional Margarita Stolbizer, quien sostuvo que había irregularidades en la empresa.